學(xué)校從2000年開始就嘗試各種改革來提高研究生培養(yǎng)質(zhì)量，每年都會(huì)有一些新的政策調(diào)整，學(xué)校實(shí)施了十個(gè)“研究生教育創(chuàng)新工程”，主要包括研究生生源擴(kuò)展、研究生教育資源開發(fā)、研究生自選課題資助、優(yōu)秀博士論文建設(shè)、研究生訪學(xué)與學(xué)術(shù)交流、國(guó)內(nèi)外研究生教育合作等。所培養(yǎng)的博士研究生于2000年、2002年和2005年3次入選教育部“全國(guó)百篇優(yōu)秀博士論文”， 
　　從2008年起，北京林業(yè)大學(xué)開始試行研究生培養(yǎng)機(jī)制改革，研究生招生類別調(diào)整為三類：
　�、俜窃诼氀芯可�：無工作單位，非在職脫產(chǎn)學(xué)習(xí)，必須轉(zhuǎn)工資關(guān)系、檔案，可轉(zhuǎn)戶口，畢業(yè)按照國(guó)家政策可參加就業(yè)派遣。
　　②委托培養(yǎng)研究生：有工作單位，在職脫產(chǎn)或不脫產(chǎn)學(xué)習(xí)，不轉(zhuǎn)檔案戶口，畢業(yè)后須回委托培養(yǎng)單位就業(yè)。
　�、蹖ｍ�(xiàng)計(jì)劃培養(yǎng)研究生：北京林業(yè)大學(xué)目前僅有少數(shù)民族骨干專項(xiàng)計(jì)劃，錄取的該類研究生畢業(yè)后須回定向單位或地區(qū)就業(yè)，檔案戶口按照國(guó)家相關(guān)政策規(guī)定管理。（其它詳情請(qǐng)查詢北京林業(yè)大學(xué)的少數(shù)民族骨干計(jì)劃招生簡(jiǎn)章）
　　另外為改善研究生培養(yǎng)條件，激發(fā)研究生創(chuàng)新實(shí)踐的熱情，北京林業(yè)大學(xué)每年的獎(jiǎng)學(xué)金覆蓋面達(dá)70%以上，一等獎(jiǎng)學(xué)金獲得者學(xué)費(fèi)全免，二等獎(jiǎng)學(xué)金免除一半學(xué)費(fèi)。除此以外，在校的非在職碩士研究生每人每年都有不低于4000元的津貼，這是由學(xué)校及導(dǎo)師共同來提供的。表現(xiàn)優(yōu)異的學(xué)生還有機(jī)會(huì)獲得優(yōu)秀獎(jiǎng)學(xué)金等及其他獎(jiǎng)學(xué)金及助研津貼�！　�