土木工程系創(chuàng)建于1926年，是清華大學比較早成立的工程系科之一，在國內外有良好的聲譽和影響。2000年與水利水電工程系合并成立土木水利學院，由原土木工程系的“工程管理”專業(yè)基礎上新成立建設管理系。目前，土木工程系與建設管理系聯(lián)合招生，學生入學一年后根據志愿再選擇。

　　土木工程系和建設管理系現有教職工87人，其中中國工程院院士2人，教授32人，長江學者特聘教授2人，副教授(含副研)20人，講師7人。設有結構工程研究所、防災減災工程研究所、建筑材料研究所、巖土工程研究所、交通工程研究所、地球與空間信息研究所及結構力學教研室，以及大型工程結構實驗室、土木工程計算機應用實驗室、建筑材料實驗室和工程測量實驗室，還有建筑工程設計研究所和交通工程設計所。系資料室，與校圖書館形成互補，國內外各類藏書和資料豐富。全系各實驗室、辦公室和資料室擁有計算機800余臺，均實現聯(lián)網。

　　土木工程專業(yè)本科培養(yǎng)掌握扎實的數學和力學基本理論和基礎知識，具備從事土木工程的項目規(guī)劃、設計、研究開發(fā)、施工及管理能力，能在房屋建筑、地下結構、橋梁、道路等領域的設計、研究、施工、教育、管理部門從事技術或管理工作的高級工程技術人才。具有較高的外語水平和熟練的計算機應用能力，并獲得科學研究方法的初步訓練。本專業(yè)學生具有廣泛的適應性，畢業(yè)后可到各工程設計研究單位，建筑企業(yè)，工程管理部門，對外工程承包公司，交通工程部門，房地產部門工作。

　　長期以來，土木工程系一直保持高水平的教學傳統(tǒng)，有1人獲得國家級名師稱號，“結構力學”和“混凝土結構”分別獲得國家級和北京市精品課稱號，還有4門課程獲得校級精品課，是全校精品課較多的系，2001年以來獲得國家級和省部級教學獎5項，校級教學獎勵10余項。在搞好教學的同時，廣大教師還承擔了大量的科研工作，2001年以來承擔國家級科研項目45項、省部級科研項目50余項，國際合作研究項目7項，其它各類科研項目170余項，科研經費總計近7000萬元，2001以來獲得國家級科研成果獎3項和省部級科研成果獎27項。

　　土木工程系還積極開展國內外學術交流，組織過多次國內和國際學術會議，邀請國內外著名學者來系講學，做學術報告。還與日本東京大學、名古屋大學;美國辛辛那提大學、英國威爾士大學、國立新加坡大學、比利時布魯塞爾大學、英國曼徹斯特理工大學、愛丁堡大學、香港大學、香港理工大學和香港科技大學等簽有雙邊學術交流協(xié)議，開展國際合作科研和學術交流。

　　土木工程系有六個學科具有碩士學位授予權：結構工程、防災減災與防護工程、管理科學與工程、建筑材料、大地測量學與測量工程、交通運輸規(guī)劃與管理;四個學科有博士學位授予權：結構工程、防災減災與防護工程、管理科學與工程、建筑材料，并具有土木工程一級學科碩士、博士授予權，每年招收工學碩士生60余人，博士生近30人。還設有博士后流動站，每年招收博士后10余人。結構工程是國家重點學科，教育部“結構工程與振動重點實驗室”的主要部分也設在土木工程系。