中醫(yī)藥科學(xué)研究是中國中醫(yī)科學(xué)院的中心任務(wù)，50年來，中國中醫(yī)科學(xué)院在中醫(yī)藥基礎(chǔ)理論研究和重大疾病防治及中藥新藥開發(fā)研究等方面均取得了顯著成就。截止2004年底，全院共獲得科研成果近900項(xiàng)，其中獲國家級、部局級獎近300項(xiàng)；現(xiàn)有院級以上在研課題482項(xiàng)，其中國家級課題200項(xiàng)、部局級課題258項(xiàng)；擁有國家新藥（中藥）臨床試驗(yàn)研究中心（GCP）、國家規(guī)范化中藥藥理實(shí)驗(yàn)室、中國中醫(yī)藥文獻(xiàn)檢索中心和BSL－3實(shí)驗(yàn)室，是國家中藥安全性評價(jià)中心（GLP）與中藥復(fù)方藥物開發(fā)國家工程研究中心建設(shè)單位。

    中國中醫(yī)科學(xué)院充分發(fā)揮中醫(yī)醫(yī)療的優(yōu)勢和特色，為廣大患者提供良好的服務(wù)，現(xiàn)有病床1500多張。附屬西苑醫(yī)院、廣安門醫(yī)院是全國三級甲等中醫(yī)醫(yī)院和全國示范中醫(yī)醫(yī)院。望京醫(yī)院是以骨傷科為主的綜合性三級甲等中醫(yī)醫(yī)院，眼科醫(yī)院是以中醫(yī)眼科為特色的專科醫(yī)院。各附屬醫(yī)院在腫瘤、心腦血管病、老年病、糖尿病以及肛腸、皮膚、泌尿等各科疾病及多種常見病、多發(fā)病和疑難重癥的治療方面，具有豐富的經(jīng)驗(yàn)和獨(dú)特的療效，在國內(nèi)外有較高的聲譽(yù)。

    中國中醫(yī)科學(xué)院是培養(yǎng)高層次中醫(yī)藥人才的重要基地，現(xiàn)有中醫(yī)學(xué)、中藥學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合三個一級學(xué)科所涵蓋的所有學(xué)科專業(yè)的博士、碩士授予權(quán)，具有臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)學(xué)位授予和在職人員申請學(xué)位的資質(zhì)；設(shè)有中西醫(yī)結(jié)合、中醫(yī)學(xué)、中藥學(xué)三個一級學(xué)科的博士后工作站�！≈袊�中醫(yī)科學(xué)院圖書館是全國藏書最多的中醫(yī)藥專業(yè)圖書館，其中珍本、善本、孤本書籍2萬余冊。中國醫(yī)史博物館是中國收藏文物最多的中醫(yī)專業(yè)博物館，收藏文物3000余件。

    中國中醫(yī)科學(xué)院主辦多種全國性的中醫(yī)藥專業(yè)期刊，其中在國內(nèi)外影響較大的有《中醫(yī)雜志》、《中國中西醫(yī)結(jié)合雜志》、《中國中藥雜志》、《中國針灸》、《針刺研究》、《中國骨傷》、《中華醫(yī)史雜志》、《中國中醫(yī)藥信息雜志》、《中國中醫(yī)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)雜志》等。

    作為中國傳統(tǒng)醫(yī)藥對外合作與交流的重要窗口，中國中醫(yī)科學(xué)院與世界上100多個國家和地區(qū)的醫(yī)藥界、科研院所、高等院校、企業(yè)及民間團(tuán)體有廣泛友好的聯(lián)系與交流，在國際傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)界有較大的影響。